MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL8

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012003	ATT	2	6	22	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012003	A	7	7	40	46	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012003	TCTAA	2	10	85	94	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012003	AGGA	2	8	103	110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012003	T	6	6	122	127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012003	A	6	6	135	140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012003	GTT	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012003	TA	3	6	155	160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012003	AGA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012003	A	6	6	221	226	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
11	NC_012003	A	6	6	304	309	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
12	NC_012003	ATA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143523
13	NC_012003	TG	3	6	354	359	0 %	50 %	50 %	0 %	222143523
14	NC_012003	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143523
15	NC_012003	A	6	6	428	433	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
16	NC_012003	ATTT	2	8	436	443	25 %	75 %	0 %	0 %	222143523
17	NC_012003	TTAACG	2	12	446	457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222143523
18	NC_012003	GAA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143523
19	NC_012003	AGA	2	6	484	489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143523
20	NC_012003	A	7	7	496	502	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
21	NC_012003	GAAAA	2	10	529	538	80 %	0 %	20 %	0 %	222143523
22	NC_012003	A	7	7	535	541	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
23	NC_012003	GAT	2	6	550	555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143523
24	NC_012003	GAT	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143523
25	NC_012003	TTA	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143523
26	NC_012003	CA	3	6	730	735	50 %	0 %	0 %	50 %	222143523
27	NC_012003	A	6	6	747	752	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
28	NC_012003	AAC	2	6	764	769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143523
29	NC_012003	ATCA	2	8	821	828	50 %	25 %	0 %	25 %	222143523
30	NC_012003	A	6	6	828	833	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
31	NC_012003	AAGA	2	8	904	911	75 %	0 %	25 %	0 %	222143523
32	NC_012003	A	6	6	916	921	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
33	NC_012003	TAT	2	6	977	982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143523
34	NC_012003	ACTG	2	8	1024	1031	25 %	25 %	25 %	25 %	222143523
35	NC_012003	AAG	2	6	1032	1037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143523
36	NC_012003	A	6	6	1038	1043	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
37	NC_012003	ATCA	2	8	1049	1056	50 %	25 %	0 %	25 %	222143523
38	NC_012003	GAA	3	9	1076	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143523
39	NC_012003	A	7	7	1089	1095	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
40	NC_012003	ACC	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012003	GTGG	2	8	1147	1154	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012003	ATTT	2	8	1167	1174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012003	ATTT	2	8	1182	1189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012003	GTT	2	6	1190	1195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012003	TGA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012003	A	6	6	1216	1221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012003	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012003	T	7	7	1249	1255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012003	T	6	6	1282	1287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012003	AGTA	2	8	1388	1395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012003	A	7	7	1395	1401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012003	TA	3	6	1426	1431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012003	TA	3	6	1466	1471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012003	AT	3	6	1477	1482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012003	AT	3	6	1491	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012003	TAA	2	6	1501	1506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012003	GTAT	2	8	1520	1527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012003	TGTTA	2	10	1545	1554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012003	A	7	7	1559	1565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012003	T	6	6	1576	1581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012003	CAC	2	6	1613	1618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012003	GTG	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012003	A	6	6	1801	1806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012003	GGAGA	2	10	1857	1866	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012003	C	6	6	1870	1875	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_012003	AC	3	6	1879	1884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012003	GCTC	2	8	1978	1985	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012003	A	6	6	2003	2008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012003	T	7	7	2026	2032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012003	TA	3	6	2034	2039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012003	A	7	7	2045	2051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012003	TAAT	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012003	A	7	7	2074	2080	100 %	0 %	0 %	0 %	222143524
74	NC_012003	ATTA	2	8	2106	2113	50 %	50 %	0 %	0 %	222143524
75	NC_012003	CTT	2	6	2201	2206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143524
76	NC_012003	AGA	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143524
77	NC_012003	ATC	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143524
78	NC_012003	TG	3	6	2269	2274	0 %	50 %	50 %	0 %	222143524
79	NC_012003	GTA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143524
80	NC_012003	AAAT	2	8	2307	2314	75 %	25 %	0 %	0 %	222143524
81	NC_012003	A	7	7	2346	2352	100 %	0 %	0 %	0 %	222143524
82	NC_012003	TGG	2	6	2415	2420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222143524
83	NC_012003	GAC	2	6	2464	2469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222143524
84	NC_012003	ATT	2	6	2507	2512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012003	ATTT	2	8	2579	2586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012003	GA	3	6	2588	2593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012003	A	9	9	2593	2601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012003	ATG	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143525
89	NC_012003	A	8	8	2841	2848	100 %	0 %	0 %	0 %	222143525
90	NC_012003	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143525
91	NC_012003	GTT	2	6	2919	2924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012003	T	7	7	2923	2929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012003	ATT	2	6	2951	2956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.